В чем разница между 16s рРНК и 18s РРНК?
В чем разница между 16s рРНК и 18s РРНК?

Видео: В чем разница между 16s рРНК и 18s РРНК?

Видео: В чем разница между 16s рРНК и 18s РРНК?
Видео: Bad bacteria: 16s РНК секвенирование для определения патогенных бактерий 2024, Ноябрь
Anonim

Главный разница между выполнение анализов с 18S рРНК генные данные вместо 16S рРНК данные генов (или данные ITS) - это справочная база данных, используемая для выбора OTU, таксономических назначений и построения выравнивания на основе шаблонов, поскольку они должны содержать эукариотические последовательности.

Учитывая это, почему ген 16s рРНК используется для идентификации?

В Ген рибосомной РНК 16S кодирует компонент РНК 30S субъединицы бактериальной рибосомы. Из-за сложности гибридизации ДНК-ДНК, Ген 16S рРНК секвенирование использовал как инструмент идентифицировать бактерии на уровне видов и помогают различать близкородственные виды бактерий [8].

Кроме того, есть ли у эукариот 16s рРНК? В 16S рРНК ген присутствует во всех бактериях, и родственная форма встречается во всех клетках, включая клетки эукариоты.

Также вопрос, что такое 18s и 28s рРНК?

В 28S / 18S рибосомная РНК Коэффициент часто используется для оценки качества общей РНК, очищенной из любого данного образца. В людях, 28S рРНК имеет ~ 5070 нуклеотидов, а 18S имеет 1869 нуклеотидов, что дает 28S / 18S коэффициент ~ 2,7. Высота 28S / 18S соотношение является показателем того, что очищенная РНК не повреждена и не деградировала.

Что такое секвенирование 16s рРНК?

16S рРНК ген последовательность анализ является стандартным методом в систематике и идентификации бактерий и основан на обнаружении последовательность различия (полиморфизмы) в гипервариабельных областях 16S рРНК ген, который присутствует во всех бактериях.

Рекомендуемые: